2024-11-01 清华大学生命科学学院王新泉课题组解析人源白细胞介素-12及其受体复合物的冷冻电镜结构，揭示IL-12信号起始的分子机制 白细胞介素-12（IL-12）家族的细胞因子由α亚基（p35、p19和p28）和β亚基（p40和EBI3）构成，具有形成异源二聚体、亚基和信号组分共享的特性。目前在人体内确定的家族成员包括IL-12（由p35和p40亚基结合形成）、IL-23（由p19和p40亚基结合形成）、IL-27（由p28和EBI3亚基结合形成）以及IL-35（由p35和EBI3亚基结合形成）（图1）。这些细胞因子主要由不同类型的抗原呈递细胞、调节性T细胞和调节性B细胞产生，作用于T细胞、自然... 查看详情→

2024-11-01 清华大学生命学院江鹏实验室揭示B细胞生发中心的形成及功能的代谢基础 B细胞是适应性免疫应答系统的重要组成部分，具有包括分泌病原体特异性抗体等多种免疫效应功能。生发中心（GCs）中的体细胞超突变和B细胞选择可提高抗体对免疫抗原的亲和力和特异性。因此，生发中心（GC）B 细胞对产生 GCs 和长效体液免疫至关重要。虽然关于生发中心（GCs）的调控研究不在少数，且代谢可能影响了B细胞亚群的多样性，但生发中心B细胞（GC B）的形成与功能是否依赖或决定于一种共有的代谢方式，是一个极其令人感兴... 查看详情→

2024-11-01 闫创业与袁亚飞团队揭示去甲肾上腺素转运蛋白再摄取与抑制的分子基础 去甲肾上腺素 (Norepinephrine 或 noradrenaline；NE) 、多巴胺 (Dopamine；DA)和血清素 (Serotonin ；或5-羟色胺5-hydroxytryptamine, 5-HT) 是重要的单胺类神经递质，影响着包括运动、激素分泌、奖惩和情绪相关的复杂行为和生理过程。这些神经递质在突触前膜去极化后释放到突触间隙，随后激活突触后膜上的受体并触发影响神经元兴奋性、突触可塑性和各种生理过程的细胞内信号级联。正常生理情况下，从突触前神经元释放的神经递... 查看详情→

2024-11-01 生命学院张强锋课题组开发SPACE用于空间转录组数据分析 在多细胞生物体中，尽管所有细胞共享相同的基因组，但由于内部基因调控网络的差异以及与周围微环境中相邻细胞的外部信号交流，它们在形态、基因表达和功能上展现出显著的多样性。相邻的不同种类细胞之间再通过复杂的相互作用，形成一定功能的组织模块。近年来，随着空间转录组技术的不断发展，研究者能够在单细胞分辨率下获得细胞的基因表达谱，同时保留细胞在组织内的空间位置信息。因此，如何有效地利用这些空间位置信息来揭... 查看详情→

2024-07-03 清华大学颉伟组和南京医科大学李晶组合作揭示增强子在卵子发生及早期胚胎发育中的转录调控机制 哺乳动物的卵子成熟和早期胚胎发育是一个高度复杂的过程，需要精确的基因调控和表观遗传调控。然而，其转录调控网络及相关元件目前还有待深入研究。增强子作为调控基因表达的重要元件能够帮助远程激活和调控基因表达。然而，由于实验材料的稀缺，增强子在哺乳动物卵子发生和早期胚胎发育过程中参与基因表达调控的机制目前鲜有研究。在小鼠等哺乳动物卵子及早期胚胎中，诸多表观基因组特征呈现出非经典模式，且在受精及着床前后... 查看详情→

2024-07-03 生命学院李雪明课题组和电子系沈渊课题组合作开发冷冻电子断层成像倾转系列的离焦量测量方法 冷冻电子断层成像（cryo-electron tomography, cryoET）技术可以观察细胞中生物大分子的原位结构，近年来受到了广泛关注。生物样品在冷冻电镜成像的过程中受到衬度传递函数（contrast transfer function, CTF）的影响，无法直接反映原始的结构信息。在实现高分辨率的蛋白质结构解析和电镜图像质量评估的过程中，依托CTF准确估计离焦量参数，对后续消除CTF的影响十分重要。目前常用的离焦量估计方法通常依托图像功率谱中的CTF衍... 查看详情→

2024-11-07 清华大学药学院饶燏团队开发基于降解的蛋白质分析策略：以雷公藤红素的靶点研究为例 背景介绍PROTAC（PROteolysis TArgeting Chimera）PROTAC技术是近年来新兴的前沿化学生物技术。其原理是通过一个异双功能小分子同时拉近目标蛋白和E3泛素连接酶之间的距离，进而诱导目标蛋白的多聚泛素化以及通过泛素-蛋白酶体途径的降解。目前为止，该技术已经成功实现了上百种靶蛋白的降解。靶点鉴定（Target identification）天然产物作为药物发现的重要来源，拥有多样的化学结构及广泛的生物学活性。通过表型筛选，科学家们... 查看详情→

2024-07-03 生命学院王宏伟课题组和精密仪器系欧阳证、周晓煜课题组合作开发基于电喷雾电离技术的冷冻电镜样品制备方法用以解决冷冻样品的界面效应问题 生物大分子的三维结构可以直观地揭示其生物学功能、细胞内进程以及探索其在疾病中发挥作用的方式。冷冻电镜（cryo-electron microscopy, cryo-EM）单颗粒分析技术通过对生物大分子的直接成像进行高分辨率结构测定，已成为结构生物学的重要研究手段。冷冻电镜单颗粒技术需要对生物大分子溶液的冷冻样品采集大量电子显微数据，以进行三维结构解析，因此高质量的冷冻样品制备在冷冻电镜技术中起着至关重要的作用。良好的制样方法需... 查看详情→

2024-07-03 生命学院颜宁、闫创业和潘俊敏团队合作首次揭示多聚糖介导生物复杂构造组装的分子机制 糖和脂类与蛋白、核酸一样都是构成生物结构、完成生理功能必不可缺的大分子，但是与后两者相比，糖与脂类的结构难以解析，属于细胞中的暗物质（Dark matter），糖生物学(Glycobiology)是生命科学业界公认的高难领域（图1）。糖对于生命至关重要：以葡萄糖为代表的糖类分子是细胞代谢主要的能量来源之一，植物中的细胞壁由纤维素构成，糖基化也是重要的翻译后修饰(Posttranslational modifications, PTM)形式之一，可显著扩展蛋... 查看详情→

2024-07-03 生命学院杨雪瑞课题组开发单细胞剪接谱分析工具，提出解读复杂组织细胞异质性的新思路 大多数生理与病理组织都具有高度的细胞异质性。对异质细胞谱图的系统解读以及关键细胞亚型的精准鉴定对于理解组织发育及其功能、细胞互作微环境、疾病动态发展等生理与病理过程具有重要价值。当前主流的细胞异质性分析以单细胞转录组数据为基础，使用基因表达谱信息定义细胞类群，绘制了大量复杂生理与病理组织的异质性谱图。但是长期以来，这一类异质性分析停留于基因层面，未能达到基因转录本的解析度，几乎完全忽略了RNA可变... 查看详情→