蛋白质化学与组学平台
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清华大学蛋白质化学与组学平台隶属于清华大学蛋白质研究技术中心,向全校各实验室和研究中心提供质谱、蛋白质组学和代谢组学的分析服务。蛋白质化学平台已配备的仪器包括: MALDI-TOF/TOF 质谱仪,高效液相色谱质谱联用仪(LTQ Orbitrap velos, Q Exactive, Q Exactive HF-X, Orbitrap Fusion Tribrid, Orbitrap Fusion LUMOS, Synapt G2, Orbitrap Ascend Tribrid,Exploris 480和Astral),高效液相色谱仪,Edman蛋白测序仪。
蛋白质化学平台提供的技术服务:
1、蛋白质鉴定,包括蛋白定性和翻译后修饰鉴定;
2、蛋白N/C端分析,包括Edman测序和基于质谱技术的NC端分析;
3、蛋白质质量的精确测定,包括MALDI和蛋白质原位质谱分析;
4、单细胞蛋白质组学分析;
5、组织或细胞的定量蛋白质组学分析,包括基于SILAC标记的相对定量蛋白质组学分析,基于TMT标记的相对定量蛋白质组学分析,非标记相对定量蛋白质组学分析;
6、蛋白质翻译后修饰谱的质谱分析,包括磷酸化修饰蛋白质组学分析,乙酰化修饰蛋白质组学分析,泛素化修饰蛋白质组学分析,谷胱甘肽化和其他氧化修饰蛋白质组学分析;
7、蛋白质氢氘交换质谱分析和化学交联质谱分析;
8、微量样品的蛋白质组学分析;
9、目标蛋白靶向绝对定量分析和基于质谱的western blotting;
10、抗体全序列测定;
11、组蛋白翻译后修饰谱的鉴定;
12、细胞膜蛋白组学分析;
13、鉴定活性分子靶标蛋白的热蛋白组分析。
预约方式:Biacore仪器为网站预约,其他服务项目可电话、邮件咨询,或直接送样并填写样品登记表。
联系方式:010-62788502
邮件地址(发送邮件时请将"#"替换为"@"):
邓海腾 dht#mail.tsinghua.edu.cn
陈宇凌 chenyuling2016#mail.tsinghua.edu.cn
韩 萌 hanmeng#mail.tsinghua.edu.cn
李 进 lijin2014#mail.tsinghua.edu.cn
田晓琳 tianxiaolin#mail.tsinghua.edu.cn
晏顶霏 yandingfei#mail.tsinghua.edu.cn
马青青 mqq#mail.tsinghua.edu.cn
荣文婉 rww#mail.tsinghua.edu.cn
地址:北京市海淀区清华大学生物医学馆U5-028
点击链接:http://phoenix.tsinghua.edu.cn/index.php?c=show&id=584 获取更多平台实验方法!

邓海腾平台主管、教授
主要技术专长:
1996年在宾州州立大学获得博士学位,之后在阿拉伯塔大学和橡树岭国家实验室从事博士后研究,先后在爱因斯坦医学院和内布拉斯加大学担任助理教授,回国前任洛克菲勒大学研究副教授和蛋白质组学分析中心的主任。现担任清华大学生命科学学院教授和蛋白质化学及组学平台主管。主要研究领域为发展和应用蛋白质组学、代谢组学和化学生物学的技术和方法;研究氧化还原生物学在衰老和疾病中的功能和作用机制。
查看更多 →仪器设备
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超分辨率液质联用仪(Orbitrap Astral质谱仪) Orbitrap Astral质谱仪结合了Orbitrap和Astral两大质量分析器技术,兼具超高灵敏度、超快扫描速度和精准定量分析能力。其核心优势在于双分析器设计:Orbitrap提供超高分辨率(最高480,000)和亚ppm级质量精度,适用于复杂样品鉴定;而新型Astral分析器扫描速度比传统Orbitrap快20倍,可检测fg级低丰度分子,显著提升通量(每秒40张MS/MS谱图)。该仪器还整合了FAIMS Pro离子淌度接口,通过动态电场过滤干扰离子,进一步优化选择性。在应用中,Orbitrap Astral可深度覆盖蛋白质组、精准定量代谢物及解析小分子结构,广泛应用于药物开发、生物标志物发现和临床研究等高要求场景,推动前沿科研与临床应用。 查看详情 →
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超分辨率液质联用仪(Orbitrap Ascend Tribrid 质谱仪) Orbitrap Ascend Tribrid 质谱仪的核心在于独特的三合一架构,集成了四极杆、线性离子阱以及 Orbitrap 质量分析器,同时该仪器支持多种碎裂模式(CID、HCD、ETD、UVPD),并拓展质量检测范围至16,000 m/z,实现了无与伦比的灵活性。该仪器具备卓越的性能指标,包括超高灵敏度、快速扫描速度(在高分辨率下)和宽动态范围,并支持多级质谱(MSⁿ)和多种碎裂技术。凭借其强大的功能,Orbitrap Ascend 主要应用于深度蛋白质组学(大规模蛋白鉴定、定量、翻译后修饰分析)、代谢组学/脂质组学、结构生物学(如 HDX-MS)、生物制药深度表征(单抗、ADC 等)以及生物标志物发现和小分子结构确证等领域,是解决最复杂生命科学和生物制药挑战性问题的顶尖平台之一。 查看详情 →
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超分辨率液质联用仪(Orbitrap Exploris 480质谱仪) Exploris 480 是一款高性能、高稳定性的超高分辨率质谱仪,核心基于 Orbitrap质量分析器技术。它专为要求苛刻的蛋白质组学、代谢组学、生物制药表征等研究领域设计,提供出色的分辨率(最高可达 480K FWHM)、质量精度和灵敏度。该仪器以其快速扫描速度和强大的定量能力著称,能够高效处理复杂样品,进行深度覆盖的定性和定量分析。Exploris 480 结合了优异的性能与坚固可靠的系统设计,为用户提供值得高可信度的质谱解决方案。 查看详情 →
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ultrafleXtreme MALDI-TOF/TOF飞行时间质谱仪 ultrafleXtreme在TOF和TOF/TOF模式下,分别能达到2 kHz和1 kHz的高性能采集速率,独特的宽域聚焦技术 (PAN) 能在很宽的质量范围内同时获得极高的质量分辨率。创新的FlashDetector™ 检测器结合4GHz 的数字转换器和最先进的电子技术,可提供高达40,000 的高质量分辨率,以及高达1ppm 的质量准确度。具备先进的TOF/TOF技术,高效和高灵敏度的 LID-LIFT 过程可实现多肽同位素分辨的MS/MS质谱图。高达1000 Hz的MS/MS数据采集速率能在几秒钟之内完成fmol水平样品的数据采集。配套的生物信息学软件可将原始数据转化为直观的多肽注释和蛋白结构信息,充分满足临床和应用蛋白质组学的研究的需要。 查看详情 →
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液相色谱质谱联用系统(Q Exactive LC-MS/MS) 质谱仪Q Exactive将高性能四极杆的母离子选择性与高分辨的准确质量数(HR/AM)Orbitrap检测技术相结合,提供优异性能和出色的多功能性。该仪器能够更好的应用于化合物定性和定量检测、抗体测序及氢氘交换分析。通过硬件及软件上方法的改进,使该仪器发挥其最大的功能优势。例如,在氢氘交换的测试中,出峰时间缩短到6分钟,将backexchange降低到30%以下,进一步提高数据的可靠性。其快速交替的正负极扫描模式支持最复杂的分析方法,在筛选实验中节约时间。 查看详情 →
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超高效液相色谱系统(Hclass) ACQUITY UPLC H-Class系统是一套经过优化的先进系统,具有四元溶剂混合的灵活性和简易性,并带有一个流通针式进样器,实现了UPLC分离的先进性能(高分离度、灵敏度和高通量),同时还保持了ACQUITY UPLC系统公认的耐用性和可靠性。可用于大分子以及化合物的定性,定量分析。具有很高选择性和重现性。 查看详情 →
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超高效液相色谱系统(2535Q) Waters 2535Q是一款半制备液相色谱,可用于mg级目标分析物。主要应用于小规模多肽及蛋白质等的分离纯化,应用领域涉及药物研发,生物技术,化学化工以及食品与饮料等。 查看详情 →
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多肽蛋白测序仪 岛津蛋白/肽测序仪, 在传统PPSQ系列功能的基础上,将原有的PPSQ系统与HPLC系统的双系统软件整合在一起,可使分析条件的选择,反应步骤及分析结果等可简单地在一画面运行。具有3个样品分析通道,可以连续进行样品检测,提高了样品的的分析通量。通过降低噪音水平,提高了PTH-氨基酸检测的灵敏度。 查看详情 →
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超分辨率液质联用仪(Orbitrap Fusion) Orbitrap Fusion仪器实现了三个不同质量分析器的共同协作,将分析性能提升至全新的高度。轻松实现多种不同类型样品的检测。四极杆用于进行母离子选择,分辨率最低可达0.4 amu,具有出色的灵敏度和选择性;(2)超高场Orbitrap提供超过450,000的分辨率和高达15 Hz的扫描速率,具有超高的分析选择性和速度。 查看详情 →
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超分辨率液质联用仪(Orbitrap Fusion LUMOS Tribrid) Orbitrap Fusion Lumos 三合一质谱系统在极具挑战性的应用中表现突出,包括低水平 PTM 分析、使用同量异序标签(TMT)进行多通路相对定量测定、完整蛋白表征以及对肽段进行 MSn 分析。该系统还配备了ETD模块,可以进行ETHCD碎裂对磷酸化,糖基化等修饰位点鉴定提供帮助。 查看详情 →
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高分辨质谱系统 SYNAPTTM G2-Si HDMS质谱分析系统是Waters公司最新一代基于高效离子淌度(ion mobility spectrometry, IMS)技术的高性能Q-TOF质谱仪。通过这两种技术的完美结合,SYNAPTG2-Si 不仅能按离子的质荷比分离检测,还可根据离子的大小、形状等物理性质将其分离。因此,此质谱系统不但可以提高传统质谱数据的准确性,更可以提供样品形态等结构信息。SYNAPT G2-Si可以对复杂混合物和分子进行详尽表征。该仪器在蛋白质组学、蛋白质的相互作用以及蛋白质复合物分析等方面有着广泛的应用空间。 查看详情 →
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生物分子相互作用仪(Biacore T200) Biacore T200 是一种万用的、无标记系统,用于生物分子作用的详细分析,适用范围从早期药物开发研究到开发,直至质量控制。系统提供高质量动力学、亲和性、浓度、特异性、选择性以及热动力学作用数据,这些分析均实时地、高灵敏度地完成。此系统可以更高的精度和自信度完成动力学范围末端发生的相互作用分析。Biacore T200 支持使用 96 孔和 384 孔微孔板以及试瓶。 由于同时使用四个流动池要,可同时对四种相互反应进行监测。 Biacore T200 的样本仓可冷却至 4°C,从而可在无人看护的情况下,对敏感型样本进行长达 48 小时的分析。 查看详情 →
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傅里叶变换高分辨质谱(LTQ Orbitrap Velos) LTQ Orbitrap Velos 由两种不同类型的质谱仪构成。前面是二维线性离子阱质谱LTQ velos,提供结构碎片信息,后面是Orbitrap高分辨质谱,进行高分辨测量,二者之间通过一个弯曲的双曲面四极杆称为C-trap相连接。LTQ velos是可独立工作的低分辨质谱,可完成所有的离子阱质谱如MS、MS/MS、MSn分析。在进行高分辨质谱分析时,LTQ Velos的作用时富集离子和产生多级碎片,传输到C-Trap后被压缩至狭窄一束后通过S透镜送入Orbitrap。根据样品的复杂程度和分析要求,可设置Orbitrap的分辨率从7500一直到100000。在分辨率大于30000时,可设置LTQ Velos和Orbitrap联动模式,即在Orbitrap进行高分辨扫描时,LTQ Velos可同时进行多个数据关联的MS/MS或MSN的扫描,是真正的高、低分辨双质谱同时分析。 查看详情 →
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超分辨率液质联用仪(Q Exactive HF-X) Q Exactive HF-X 质谱仪具有低至fg级的灵敏度、高达24万的分辨率和不少于18 Hz的扫描速度,以及抗污染的分段式四级杆,为深度分析、定量准确性和重现性设定了新的标准,为生命科学研究和生物制药应用的挑战性工作提供卓越的数据质量,可用于综合蛋白质组分析和定量、生物标志物发现和验证、以及复杂生物治疗学的全面表征分析等。 查看详情 →
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飞行时间质谱仪(MALDI-TOF/TOF) AB Sciex 4800 plus TOF/TOF飞行时间质谱仪采用基质辅助激光解吸电离技术,待样品与基质混合后形成晶体,激光脉冲使其离子化。离子被加速后飞向无场区域,在这里不同质荷比的离子由于速度不同而分离。仪器具备reflectron和linear两种模式,可满足不同质量的样品测试。 查看详情 →
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UltiMate™ 3000 标准四元系统 赛默飞 UltiMate™3000 液相液质色谱仪集成了快速分离所需的硬件, 适用于需要 HPLC 或入门水平 UHPLC 兼容系统的实验室。具有集成到泵模块中的 4 通道溶剂脱气装置,推荐将四元泵用于使用了传统 3-5 µm 粒径色谱柱或较短 UHPLC、亚 2 µm 粒径色谱柱的方法中。自动样品处理技术、强大的软件适用于包括常规分析和超快速分析在内的全部应用。典型使用领域为制药产业的 QA/QC、食品、环境方法等领域。 查看详情 →