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冷冻电镜平台主管：雷建林
冷冻电镜平台主要应用冷冻电镜三维重构技术，对生物学样品实现高分辨三维结构解析。
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X射线晶体学平台主管：范仕龙
蛋白质X射线晶体学平台是国家蛋白质设施研究（清华）基地的平台之一，位于清华大学生物医学馆U6。
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生物样品制备与鉴定平台主管：李文奇
蛋白质分子的表达纯化和制备是所有蛋白质科学研究的基础。清华蛋白质设施的蛋白质制备与鉴定平台在建成后具备规模效应，能充分发挥对蛋白质结构及功能研究的支撑作用。平台面向高校、研究中心、小型生物医药公司等，提供原核、酵母、昆虫细胞、哺乳动物细胞等4种表达体系的小试及中试蛋白质表达制备的相关服务，涵盖分子克隆，表达纯化，性质鉴定和相互作用分析等一系列相关研究。
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核磁技术平台主管：薛毅
核磁共振技术是结构生物学研究的三大手段之一，是探索蛋白质、核酸等生物大分子在溶液状态下的三维结构...
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细胞影像平台主管：王文娟
细胞影像平台作为一个综合型光学显微镜平台，以科研服务为宗旨，面向清华大学和校外单位提供光学显微镜分析测试和图像处理分析等。
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代谢与脂质组学平台主管：刘晓蕙
代谢与脂质组学平台隶属于国家蛋白质科学研究（北京）设施清华基地...
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蛋白质化学与组学平台主管：邓海腾
蛋白质化学与组学平台提供定量蛋白质组学、蛋白质鉴定、抗体分析以及临床样品分析等技术支持和服务...
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基因测序与分析平台主管：杨雪瑞
基因测序与分析平台，隶属于国家蛋白质科学研究（北京）设施清华基地，为生命科学研究提供基因组学与合成生物学解决方案。目前能够完成包括：全基因组从头测序、全基因组重测序、转录组测序、宏基因组测序、单细胞分选、单细胞转录组测序、目标区域测序、外显子测序、高通量寡聚核苷酸合成、基因合成、基因组合成等多个应用方向，已经为多个大型研究项目提供测序和信息分析服务。平台开放的仪器有Hiseq2500，Oligoarray寡核苷酸合成仪，C1单细胞制备系统， BioMark HD微流控芯片基因分析系统，2100生物分析仪，
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细胞功能分析平台主管：刘春春
细胞功能分析平台主要为各高校、研究中心提供细胞生物学功能分析测试服务，包括定性、定量分析细胞膜、细胞质及细胞核中细胞成分、研究细胞的功能状态、分离和培养特定细胞等。
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生物计算平台主管：杨涛
清华生物计算平台通过搭建专用的高性能计算机集群，以承载和支撑大规模生物和医学计算为中心任务，充分利用其大数据处理和并行计算能力，并进一步为大数据地高效处理和分析提供创新机制。
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BSL-1公共平台主管：范仕龙
平台用途主要是为了针对有涉新方面研究的用户提供蛋白质表达制备、分离纯化，鉴定和定量研究方面的技术支撑服务，已通过海淀区卫健委备案的BSL-1级的涉新实验室。
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BSL-2公共平台主管：范仕龙
平台在空间和设备方面满足了生物安全二级的防护要求，能够为实验室开展第三、四类和少量第二类病原微生物相关的培养、分离、纯化等科研活动提供实验平台。
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蛋白质设施办公室主管：范仕龙
蛋白质设施办公室于2017年正式成立，目前共7位人员，设置办公室主任岗位，负责办公室日常运行及行政管理工作，同时设人事助理、财务助理、行政助理、设备助理、宣传助理、维护工程师各1名。日常工作内容包括职能部门工作协调、文书草拟报送、信息通知发布、会务组织安排、数据收集统计、仪器设备管理、人员招聘考核、资料档案管理、计算机网络维护、财务管理、实验室安全、文化宣传等。
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用户服务中心主管：徐艳姬
汇总重点或者高端需求用户对平台的整体意见建议、设备和技术需求等，评估平台测试能力
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