基因测序与分析平台,隶属于国家蛋白质科学研究(北京)设施清华基地,为生命科学研究提供基因组学与合成生物学解决方案。目前能够完成包括:全基因组从头测序、全基因组重测序、转录组测序、宏基因组测序、单细胞分选、单细胞转录组测序、目标区域测序、外显子测序、高通量寡聚核苷酸合成、基因合成、基因组合成等多个应用方向,已经为多个大型研究项目提供测序和信息分析服务。
目前已经拥有开放仪器包括:Illumina New Hiseq 2500(1T)测序仪、Fluidigm Biomark HD数字PCR仪、Fluidigm C1单细胞分选和测序系统、Oligo Array高通量寡聚核苷酸制备系统、Agilent Bravo自动移液工作站等。
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杨雪瑞平台主管、副教授
主要技术专长:
基因组学与癌症系统生物学:发挥交叉学科的优势,利用统计学、数学、信息科学、计算机科学的概念与工具,针对复杂疾病及相关重要生物学问题开发多组学大数据的生物信息分析方法,并结合实验生物学手段研究肿瘤中基因转录、转录后及翻译组的调控过程,为理解肿瘤致病通路、鉴定干预靶点提供方法学支持、新的科学假说及分子机理信息。实验室有机地结合计算与实验的优势,并开展广泛的合作研究。
查看更多 →仪器设备
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基因测序分析系统(高通量测序仪) 平台拥有的是Illumina公司最新版本的的高通量测序仪Hiseq2500,采用V4试剂能达到1T的数据量,并且时间比原来缩短1/3。Illumina的Hiseq测序平台是目前全球市场占有率最高,通量最高,认可度最高的高通量测序平台。Hiseq 2500是2012年底上市的最新型号,平台拥有的是其最新版本,具有几个突出的特点:通量高,费用低,应用广泛灵活,数据质量高,国际认可度高。 查看详情 →
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Oligoarray寡核苷酸芯片合成仪 Oligoarray寡核苷酸芯片合成仪是用于在芯片上一次同时合成大量的寡核苷酸(一般为2000~720000条Oligo),合成后的寡核苷酸可以从芯片上剪切下来(化学剪切),这些寡核苷酸,根据使用者的设计,可以是引物序列,做为Oligo Pool,或者用于目标测序的全基因组外显子捕获,因此这些合成的Oligo可以是全基因组外显子引物序列-进行下游的全基因组外显子测序,也可以是设计的目标序列测序的引物-进行下游的目标序列测序。合成的这些寡核苷酸也可以是用来合成基因,即合成后的寡核苷酸被用于连接起来,合成基因。 查看详情 →
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C1单细胞制备系统 配备超低温探头,相比常温探头灵敏度高;可以运行1H/13C/15N/2H相关的各种实验;可以处理从低盐到高盐的各种盐浓度的样品。 查看详情 →
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BioMark HD微流控芯片基因分析系统 Fludium公司的BioMark HD微流控芯片基因分析系统利用集成流体通路(Integrated Fluidic Circuit,IFC)技术、实时荧光定量PCR技术与强大的基因分析软件相结合的技术平台。集成液体通路技术,即利用先进的集成工艺(光刻)在硅胶上刻上许多纳米级微管和纳米级微仓制成反应阵列,并通过独立的纳米级微型阀门控制溶液在阵列反应仓(Reaction Chamber)中的流动来实现生物样品的分液、混合、PCR扩增。并进行定量荧光检测,数据分析处理。可以实现高通量实时荧光定量PCR,数字PCR,基因分型等功能,目前有48x48和96x96两种规格的芯片,48x48指的是同时对48个样本做48个基因位点的检测。 查看详情 →