2024-07-03 清华大学颉伟组和南京医科大学李晶组合作揭示增强子在卵子发生及早期胚胎发育中的转录调控机制 哺乳动物的卵子成熟和早期胚胎发育是一个高度复杂的过程，需要精确的基因调控和表观遗传调控。然而，其转录调控网络及相关元件目前还有待深入研究。增强子作为调控基因表达的重要元件能够帮助远程激活和调控基因表达。然而，由于实验材料的稀缺，增强子在哺乳动物卵子发生和早期胚胎发育过程中参与基因表达调控的机制目前鲜有研究。在小鼠等哺乳动物卵子及早期胚胎中，诸多表观基因组特征呈现出非经典模式，且在受精及着床前后... 查看详情→

2024-07-03 生命学院李雪明课题组和电子系沈渊课题组合作开发冷冻电子断层成像倾转系列的离焦量测量方法 冷冻电子断层成像（cryo-electron tomography, cryoET）技术可以观察细胞中生物大分子的原位结构，近年来受到了广泛关注。生物样品在冷冻电镜成像的过程中受到衬度传递函数（contrast transfer function, CTF）的影响，无法直接反映原始的结构信息。在实现高分辨率的蛋白质结构解析和电镜图像质量评估的过程中，依托CTF准确估计离焦量参数，对后续消除CTF的影响十分重要。目前常用的离焦量估计方法通常依托图像功率谱中的CTF衍... 查看详情→

2024-11-07 清华大学药学院饶燏团队开发基于降解的蛋白质分析策略：以雷公藤红素的靶点研究为例 背景介绍PROTAC（PROteolysis TArgeting Chimera）PROTAC技术是近年来新兴的前沿化学生物技术。其原理是通过一个异双功能小分子同时拉近目标蛋白和E3泛素连接酶之间的距离，进而诱导目标蛋白的多聚泛素化以及通过泛素-蛋白酶体途径的降解。目前为止，该技术已经成功实现了上百种靶蛋白的降解。靶点鉴定（Target identification）天然产物作为药物发现的重要来源，拥有多样的化学结构及广泛的生物学活性。通过表型筛选，科学家们... 查看详情→

2024-07-03 生命学院王宏伟课题组和精密仪器系欧阳证、周晓煜课题组合作开发基于电喷雾电离技术的冷冻电镜样品制备方法用以解决冷冻样品的界面效应问题 生物大分子的三维结构可以直观地揭示其生物学功能、细胞内进程以及探索其在疾病中发挥作用的方式。冷冻电镜（cryo-electron microscopy, cryo-EM）单颗粒分析技术通过对生物大分子的直接成像进行高分辨率结构测定，已成为结构生物学的重要研究手段。冷冻电镜单颗粒技术需要对生物大分子溶液的冷冻样品采集大量电子显微数据，以进行三维结构解析，因此高质量的冷冻样品制备在冷冻电镜技术中起着至关重要的作用。良好的制样方法需... 查看详情→

2024-07-03 生命学院颜宁、闫创业和潘俊敏团队合作首次揭示多聚糖介导生物复杂构造组装的分子机制 糖和脂类与蛋白、核酸一样都是构成生物结构、完成生理功能必不可缺的大分子，但是与后两者相比，糖与脂类的结构难以解析，属于细胞中的暗物质（Dark matter），糖生物学(Glycobiology)是生命科学业界公认的高难领域（图1）。糖对于生命至关重要：以葡萄糖为代表的糖类分子是细胞代谢主要的能量来源之一，植物中的细胞壁由纤维素构成，糖基化也是重要的翻译后修饰(Posttranslational modifications, PTM)形式之一，可显著扩展蛋... 查看详情→

2024-07-03 生命学院杨雪瑞课题组开发单细胞剪接谱分析工具，提出解读复杂组织细胞异质性的新思路 大多数生理与病理组织都具有高度的细胞异质性。对异质细胞谱图的系统解读以及关键细胞亚型的精准鉴定对于理解组织发育及其功能、细胞互作微环境、疾病动态发展等生理与病理过程具有重要价值。当前主流的细胞异质性分析以单细胞转录组数据为基础，使用基因表达谱信息定义细胞类群，绘制了大量复杂生理与病理组织的异质性谱图。但是长期以来，这一类异质性分析停留于基因层面，未能达到基因转录本的解析度，几乎完全忽略了RNA可变... 查看详情→

2024-02-20 药学院张从刚课题组在Immunity发文报道新型cGAMP降解酶和新型cGAS-STING通路小分子抑制剂 2023年10月26日，清华大学药学院张从刚课题组在Immunity期刊发表了题为“SMPDL3A is a cGAMP-degrading enzyme induced by LXR-mediated lipid metabolism to restrict cGAS-STING DNA sensing”的研究论文。该研究发... 查看详情→

2024-02-20 药学院刘翔宇及其合作者发文揭示人源前列腺素F2α（PGF2α）受体对配体及G蛋白选择性的分子机制 最新科研速递： 2023年12月8日清华大学药学院刘翔宇课题组与中南大学湘雅医院产科张卫社课题组合作在Nature Communications以长文形式在线发表了题为“Structures of human prostaglandin F2α receptor reve... 查看详情→

2024-02-20 医学院李海涛课题组合作揭示SPINDOC 衰减Spindlin1转录共激活作用的分子机制 表观遗传机制是真核细胞丰富基因表达层次的重要策略。组蛋白翻译后修饰可以调控下游基因转录事件，不同组蛋白位点的不同的修饰类型通常需要被特定的“阅读器”识别，进而调控下游转录事件。转录共激活因子Spindlin1 ... 查看详情→

2024-02-20 生命学院刘俊杰课题组开发基于RNA核酶的新型基因编辑工具 基因承载着遗传信息，定义了生命的多样性和复杂性。基因编辑是理解和改造生命的关键技术，在生物学研究和生物产业发展中发挥着重要作用。历代基因编辑工具，如巨核酸酶、ZFNs、TALENs均以蛋白质为基础，识别和切割DN... 查看详情→